LTP

LTP concludes a curated database of type strain sequences, a universal and optimized alignment and a single phylogenetic tree harboring all the type strains of the hitherto classified species.LTP 汇编了一套精选的模式菌株（type strain）序列数据库、一套通用且优化的序列比对（alignment）结果，以及一棵涵盖迄今所有已分类物种模式菌株的单一系统发育树（phylogenetic tree）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

LTP是一个高度整理的16S rRNA基因序列数据库，专门收录细菌和古菌的模式菌株序列，并基于通用比对构建了稳健的系统发育树。其改进版本LTPlus进一步扩展了高质量非模式菌株序列，提供了完整的系统发育树和自动化的OPU方法，以支持环境序列的快速可靠分类。