Partitioned Analysis
收藏Mendeley Data2024-01-31 更新2024-06-27 收录
下载链接：
https://figshare.com/articles/dataset/Partitioned_Analysis/1439702
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
Best tree from partitioned RaxML analysis of concatinated alignment of amino acid sequences for 208 single-copy genes from 35 Agaricales taxa plus four outgroups (Newick format). Includes: -Best-scoring ML tree with branch lengths (RAxML_bestTree.AllConcatinatedProt.phy_partitioned) -Best-scoring ML tree with support values (RAxML_bipartitions.AllConcatinatedProt.phy_partitioned) -Best-scoring ML tree with branch lengths and support values as branch labels (RAxML_bipartitionsBranchLabels.AllConcatinatedProt.phy_partitioned) -Best-scoring ML trees from each bootstrap replicate (RAxML_bootstrap.AllConcatinatedProt.phy_partitioned) -Info about analysis (RAxML_info.AllConcatinatedProt.phy_partitioned)
本数据集源自针对35个伞菌目（Agaricales）类群与4个外类群的208个单拷贝基因的氨基酸序列串联比对结果所开展的分区RAxML分析，所包含的最优系统发育树文件格式为Newick。数据集包含以下内容：
- 带有分支长度信息的最优最大似然树（文件标识：RAxML_bestTree.AllConcatinatedProt.phy_partitioned）
- 带有支持值标注的最优最大似然树（文件标识：RAxML_bipartitions.AllConcatinatedProt.phy_partitioned）
- 以分支标签形式同时标注分支长度与支持值的最优最大似然树（文件标识：RAxML_bipartitionsBranchLabels.AllConcatinatedProt.phy_partitioned）
- 各自助法重复分析得到的最优最大似然树集合（文件标识：RAxML_bootstrap.AllConcatinatedProt.phy_partitioned）
- 本次分析的相关信息文档（文件标识：RAxML_info.AllConcatinatedProt.phy_partitioned）
创建时间：
2024-01-31
