Supplementary Files
收藏DataCite Commons2025-02-01 更新2024-08-26 收录
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资源简介：
Important files containing frequently used gene and TE annotation files
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1. MANE_genes_hg38: MANE annotated gene lists
2. hg38_gencode_rmsk_indi: Combination of TE individual gtf file and hg38 gencode V41 gtf file
3. hg38_repeatmasker: RepeatMasker database for hg38
4. hg38_gencode_rmsk_indi_loc_annotate: TE locational information(exonic, intronic, intergenic) at individual levels
4.long_read_TPM_simulation:TPM values from long-read used during simulating short-read in Spanki
本数据集收录常用基因与转座子（Transposable Element, TE）注释文件。
1. MANE_genes_hg38：MANE注释基因列表
2. hg38_gencode_rmsk_indi：转座子个体GTF文件与hg38 Gencode V41 GTF文件的合并文件
3. hg38_repeatmasker：适配hg38的RepeatMasker注释数据库
4. hg38_gencode_rmsk_indi_loc_annotate：个体水平的转座子位置注释信息（涵盖外显子区、内含子区与基因间区）
4. long_read_TPM_simulation：Spanki软件在模拟短读长测序数据过程中所使用的长读长测序数据对应的每百万转录本数（Transcripts Per Million, TPM）值
提供机构：
figshare
创建时间：
2023-02-03
