KnotProt: A database of proteins with knots and slipknots

KnotProt collects information about proteins with knots or slipknots. The knotting complexity of proteins is presented in the form of a matrix diagram that shows users the knot type of the entire polypeptide chain and of each of its subchains. The database presents extensive information about the biological function of proteins with non-trivial knotting and enables users to analyze new structures.KnotProt 数据库收录了带有蛋白质结（protein knots）与滑结（slipknots）的蛋白质相关信息。该数据库以矩阵图的形式展示蛋白质的结缠复杂性，可为用户呈现整条多肽链（polypeptide chain）及其各子链的结类型。该数据库还提供了大量关于带有非平凡结缠的蛋白质的生物学功能信息，并支持用户对新的蛋白质结构进行分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

KnotProt 2.0是一个专门收集含结、滑结和结状结构蛋白质信息的数据库，通过矩阵图直观展示蛋白质链的结类型及其子链的结情况。该数据库提供了这些蛋白质的详细生物学功能信息，并支持用户上传和分析自己的蛋白质结构。