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Oral microbiome gene catalog, 95% nucleotide identity

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DataCite Commons2020-08-27 更新2024-07-27 收录
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资源简介:
Non-redundant microbial gene catalog (clustered at 95% sequence identity) from 1,473 oral microbiome shotgun metagenomic samples.<br>This is one of two raw output files from CD-HIT. It is a fasta file containing the sequences of the consensus genes – the longest genes in each cluster – as well as their ID's. These ID's map back to the second CD-HIT output file, the cluster (extension: .clstr) file.<br>

本数据集为源自1473份口腔宏基因组鸟枪法样本、经95%序列同一性聚类得到的非冗余微生物基因目录。 该文件为CD-HIT软件的两份原始输出结果之一,属于FASTA格式文件,包含共有基因的序列——即每个聚类中最长的基因——及其标识符。这些标识符可映射回CD-HIT的第二份输出文件,即扩展名为.clstr的聚类文件。
提供机构:
figshare
创建时间:
2019-04-16
5,000+
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54 个
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