MOESM1 of Occurrence and expression of genes encoding methyl-compound production in rumen bacteria
收藏DataCite Commons2020-08-26 更新2024-07-27 收录
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资源简介：
Additional file 1: Table S1. A. CutC genes in the combined metagenome/metatranscriptome and Hungate1000 datasets. B. Metagenome abundance of PME genes identified from the combined metagenome/metatranscriptome and Hungate1000 datasets. C. Metatranscriptome abundance of PME transcripts of genes identified from the combined metagenome/metatranscriptome and Hungate1000 datasets. D. Top Blast hit against the 505 Pfam01095 containing ORFs identified from the rumen MAG dataset (n = 913).
附加文件1：表S1。
A. 联合宏基因组（metagenome）与宏转录组（metatranscriptome）数据集及Hungate1000数据集中的CutC基因。
B. 从联合宏基因组/宏转录组及Hungate1000数据集中共鉴定得到的果胶甲酯酶（Pectin Methylesterase, PME）基因的宏基因组丰度。
C. 从联合宏基因组/宏转录组及Hungate1000数据集中共鉴定得到的基因所对应的PME转录本的宏转录组丰度。
D. 针对从瘤胃宏基因组组装基因组（metagenome-assembled genome, MAG）数据集（n = 913）中共鉴定得到的505个包含Pfam01095结构域的开放阅读框（open reading frames, ORFs）的最优BLAST（基本局部比对搜索工具）比对结果。
提供机构：
figshare
创建时间：
2019-12-06
