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肝癌数据分析

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上海数据交易所2024-07-23 更新2026-03-21 收录
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资源简介:
肝癌,是肝脏最常见的恶性肿瘤。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。

Liver cancer is the most common malignant tumor of the liver. This product provides analytical workflows for DNA, RNA and single-cell data. Specifically, DNA-related analyses include single nucleotide mutations, structural variations, fusion gene detection and copy number variation (CNV) analyses. For RNA-seq analysis, in addition to differential gene expression analysis, it also covers de novo transcript discovery, allele-specific expression (ASE) analysis, and interactions between transcripts and non-coding RNAs. Single-cell analysis includes cell type identification, cell-cell communication, single-cell trajectory analysis and transcription factor analysis.
提供机构:
上海芯超数据科技有限公司
创建时间:
2024-07-23
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
肝癌数据分析是一个专注于肝癌研究的生物医学数据服务产品,提供DNA、RNA及单细胞的多层次分析流程。其DNA分析涵盖点突变、结构变异、融合和CNV变异,RNA分析包括基因表达差异、新转录本发现及转录本相互作用,单细胞分析则涉及细胞类别鉴定、通讯网络和轨迹分析。该产品支持全球范围的数据处理,并定期更新,适用于肝癌相关的生物医药研究。
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