Variation data of pan-genome in 1913-based allotetraploid cottons

<b>Variation data of pan-genome in 1913-based allotetraploid cottons</b>The variome data sets (SNPs, InDels, SVs. CNVs) in 1,913 cotton accessions, non-reference genome sequences and annotated genes of <i>G. hirsutum </i>and <i>G. barbadense</i> pan-genome.1. The SNPs, InDels calls in hapmap format of 1,913 cotton accession cottons.2. The SVs and CNVs in VCF format 742 cotton accessions.3. The non-reference genome sequences and gene annotations of <i>G. hirsutum </i>and<i> </i><i>G. barbadense</i> accessions.4. Gene number and presence frequency in <i>G. hirsutum </i>and<i> </i><i>G. barbadense </i>pan-genomes.

<b>1913份异源四倍体棉花泛基因组变异数据集</b>
本数据集涵盖1913份棉花种质的变异组数据集（单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism, SNPs）、插入缺失标记（Insertions-Deletions, InDels）、结构变异（Structural Variants, SVs）与拷贝数变异（Copy Number Variations, CNVs）），以及陆地棉（Gossypium hirsutum）和海岛棉（Gossypium barbadense）泛基因组的非参考基因组序列与注释基因集。
1. 1913份棉花种质的单核苷酸多态性与插入缺失标记的HapMap格式分型结果。
2. 742份棉花种质的结构变异与拷贝数变异的VCF格式文件。
3. 陆地棉与海岛棉种质的非参考基因组序列及基因注释信息。
4. 陆地棉与海岛棉泛基因组中的基因数量及基因存在频率。