RefEx2 Datasets for Arabidopsis thaliana TraVA

RefEx2 is a project to collect, organize, and curate transcriptome datasets of various species as reference resources for gene expression data analysis. It provides 6 reference datasets for four different species: humans, mice, Drosophila melanogaster, and Arabidopsis thaliana. This directory contains the following datasets on Arabidopsis thaliana TraVA:ath_TraVA_refextable_sample_stats.tsv.gzProcessed data matrixath_TraVA_refextable_grouped_sample_desc.tsvGrouped sample descriptionath_TraVA_refextable_sampleID_mapping.tsvSample ID mappingsNo. of genes: 32,431<br>No. of samples: 85Key ID: NCBI gene<br>Original data: PRJNA314076, PRJNA324514<br>Reference(s): DOI: 10.1111/tpj.13312

RefEx2是一项旨在收集、整理并编纂各类物种转录组数据集的项目，作为基因表达数据分析的参考资源。该项目为四类物种提供了6套参考数据集，分别为人类、小鼠、黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）以及拟南芥（Arabidopsis thaliana）。
本目录包含以下针对拟南芥TraVA项目的数据集：
1. ath_TraVA_refextable_sample_stats.tsv.gz：处理后的数据矩阵
2. ath_TraVA_refextable_grouped_sample_desc.tsv：分组样本描述文件
3. ath_TraVA_refextable_sampleID_mapping.tsv：样本ID映射文件
该数据集基因数量为32,431，样本数量为85。
关键ID类型为NCBI基因（NCBI gene）。
原始数据编号为PRJNA314076、PRJNA324514。
参考文献：DOI: 10.1111/tpj.13312