Supplement 1. R script and two R functions to implement the analyses described in our paper.
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File List R script: Shipley.script (md5: 3f49ef8fa2c8169aca9d9bc07a7c7bf9) R function: maxent2 (md5: f4502d0134c1f7c0c59ef6b85e6235c9) R function: maxenttest2 (md5: 33323061f78743cbb5fff8e254fc9e97) Description Shipley.script is a small R script that generated a small simulated data set consisting of six « species », one « trait » and a relative abundance distribution in the meta-community. This script then calls “maxent2” and “maxenttest2” using different arguments and performs the decomposition described in the main paper. maxent2 is a modified version of the maxent function of the FD library in R, as cited in the main paper; the FD library will eventually be updated and this maxent2 function will replace the original maxent function. maxenttest2 is a modified version of the maxent.test function of the FD library in R, as cited in the main paper; the FD library will eventually be updated and this maxenttest2 function will replace the original maxent.test function.
文件列表:R脚本:Shipley.script(MD5:3f49ef8fa2c8169aca9d9bc07a7c7bf9);R函数:maxent2(MD5:f4502d0134c1f7c0c59ef6b85e6235c9);R函数:maxenttest2(MD5:33323061f78743cbb5fff8e254fc9e97)
描述:Shipley.script 为一款小型R脚本,可生成包含6个“物种”、1个“性状”以及元群落相对多度分布的小型模拟数据集。该脚本将通过不同参数调用maxent2与maxenttest2函数,并执行主论文中所述的分解分析。
maxent2 是R语言FD库(FD library)中maxent函数的修改版本,如主论文所引;未来FD库将进行更新,该maxent2函数将取代原有的maxent函数。
maxenttest2 是R语言FD库(FD library)中maxent.test函数的修改版本,如主论文所引;未来FD库将进行更新,该maxenttest2函数将取代原有的maxent.test函数。
提供机构:
Wiley
创建时间:
2016-08-09



