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DUD-E is an enhanced and rebuilt version of DUD, a directory of useful decoys. DUD-E is designed to help benchmark molecular docking programs by providing challenging decoys. It contains: 22,886 active compounds and their affinities against 102 targets, an average of 224 ligands per target. 50 decoys for each active having similar physico-chemical properties but dissimilar 2-D topology.

DUD-E是实用诱饵库(directory of useful decoys,即DUD)的增强重构版本。该数据集旨在通过提供具有挑战性的诱饵分子,助力分子对接程序的基准测试工作。其包含22886个活性化合物及其针对102个靶点的亲和力数据,每个靶点平均对应224个配体;每个活性化合物对应50个理化性质相似但二维拓扑结构相异的诱饵分子。

提供机构:
Aston University
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数据集介绍
DUD-E 数据集图片
背景与挑战
背景概述
DUD-E是一个增强版的有用诱饵数据库,用于为分子对接程序提供具有挑战性的诱饵分子以支持基准测试。该数据集包含22,886个活性化合物及其对102个靶标的亲和力,并为每个活性化合物提供了50个具有相似物理化学性质但不同二维拓扑结构的诱饵。
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