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Detecting fish assemblages with environmental DNA: does protocol matter?

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DataCite Commons2023-07-06 更新2024-07-28 收录
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<b>Sequence reference database</b><br>File containing the sequence reference database for Guianese freshwater fish species.BdR_Guyane.txt<br><b>Run 1</b><b><br></b>Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file; 3) File with experiment name and the tags, the forward primer and the reverse primer sequence associated.<br><b>Run 2<br></b><b><br></b>Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file; 3) File with experiment name and the tags, the forward primer and the reverse primer sequence associated.<br><b>Run 3<br></b><b><br></b>Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file; 3) File with experiment name and the tags, the forward primer and the reverse primer sequence associated.<br><b>Run 4<br></b><b><br></b>Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file; 3) File with experiment name and the tags, the forward primer and the reverse primer sequence associated.<br><b>Run 5<br></b><b><br></b>Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file; 3) File with experiment name and the tags, the forward primer and the reverse primer sequence associated.<br><b>Run 6<br></b><b><br></b>Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file; 3) File with experiment name and the tags, the forward primer and the reverse primer sequence associated.<br><b>Site data</b><br>A table with 1)Site names, 2)Site codes, 3)Drainage basins, 4)Watercourse types, 5)Strahler order, 6)Latitude, 7)Longitude, 8)Sampling years for P1 samples, 9)Sample PCR codes for P1 samples, 10)Sampling years for P2 samples, 11)Sample PCR codes for P2 samplesSites_data.xls<br>

**序列参考数据库(Sequence reference database)** 包含圭亚那淡水鱼类物种的序列参考数据库文件,文件名为BdR_Guyane.txt。 **测序批次1(Run 1)** 压缩文件包含以下内容:1) 正向序列文件;2) 反向序列文件;3) 记录实验名称、标签、正向引物(forward primer)与反向引物(reverse primer)关联序列的文件。 **测序批次2(Run 2)** 压缩文件包含以下内容:1) 正向序列文件;2) 反向序列文件;3) 记录实验名称、标签、正向引物与反向引物关联序列的文件。 **测序批次3(Run 3)** 压缩文件包含以下内容:1) 正向序列文件;2) 反向序列文件;3) 记录实验名称、标签、正向引物与反向引物关联序列的文件。 **测序批次4(Run 4)** 压缩文件包含以下内容:1) 正向序列文件;2) 反向序列文件;3) 记录实验名称、标签、正向引物与反向引物关联序列的文件。 **测序批次5(Run 5)** 压缩文件包含以下内容:1) 正向序列文件;2) 反向序列文件;3) 记录实验名称、标签、正向引物与反向引物关联序列的文件。 **测序批次6(Run 6)** 压缩文件包含以下内容:1) 正向序列文件;2) 反向序列文件;3) 记录实验名称、标签、正向引物与反向引物关联序列的文件。 **样地数据(Site data)** 包含以下11项字段的表格:1) 样地名称;2) 样地代码;3) 流域;4) 水道类型;5) 斯特拉勒阶(Strahler order);6) 纬度;7) 经度;8) P1样本采样年份;9) P1样本PCR代码;10) P2样本采样年份;11) P2样本PCR代码,文件名为Sites_data.xls。
提供机构:
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创建时间:
2020-10-22
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