Expression profiling of E14 cells overexpressing Hk2/Pkm2
收藏干细胞与再生医学数据中心2022-02-20 更新2024-03-06 收录
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http://data.iscr.ac.cn/Article?id=8e300f0f1f67f81942ef54216a689311
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资源简介：
Purpose: In this study, we compared transcriptome profiling (RNA-seq) between normal mouse embryonic stem cell (E14) and Hexokinase2 (Hk2)/ Pyruvate Kinase M2 (Pkm2) overexpressed E14 cell.Result: Using an optimized data analysis workflow, we mapped over 4 billion sequence reads per sample to the mouse genome (build mm9) and identified 28698 transcripts in 5 samples.Conclusion: Our study represents the first detailed analysis of Hk2/ Pkm2 overexpressed E14 cell transcriptomes, generated by RNA-seq technology
研究目的：本研究针对正常小鼠胚胎干细胞（E14，mouse embryonic stem cell）与己糖激酶2（Hexokinase2, HK2）/丙酮酸激酶M2（Pyruvate Kinase M2, PKM2）过表达的E14细胞，开展RNA-seq转录组谱对比分析。
结果：本研究采用优化后的数据分析流程，将每个样本中逾40亿条序列读段比对至小鼠基因组（组装版本mm9），并在5个样本中鉴定出28698条转录本。
结论：本研究为首例基于RNA-seq技术的己糖激酶2/丙酮酸激酶M2过表达E14细胞转录组的精细分析。
提供机构：
Seoul National University
创建时间：
2022-02-20
