Additional file 3: of Whole genome SNP typing to investigate methicillin-resistant Staphylococcus aureus carriage in a health-care provider as the source of multiple surgical site infections

Table S3. Antibiotic resistance gene profiles from WGS data using SRST2 and the ARGannot database. Genes marked with (*) indicate non-precise matches and (?) indicates uncertainty due to coverage. A (â ) indicates the gene was absent. Different antibiotic classes are abbreviated as AGly: aminoglycosides, Bla: beta-lactamases, Fos: fosfomycin, Flq: fluoroquinolones, Gly: glycopeptides, MLS: macrolide-lincosamide-streptogramin, Phe: phenicols, and Tet: tetracyclines. (XLS 39Â kb)

补充表S3：基于全基因组测序（Whole Genome Sequencing, WGS）数据，通过SRST2工具与ARGannot数据库分析得到的抗生素耐药基因谱。标有(*)的基因表示非精确匹配，标有(?)的基因则因覆盖度问题存在匹配不确定性；标有（–）的基因表示该基因未检出。不同抗生素类别的缩写定义如下：AGly（氨基糖苷类，aminoglycosides）、Bla（β-内酰胺酶类，beta-lactamases）、Fos（磷霉素类，fosfomycin）、Flq（氟喹诺酮类，fluoroquinolones）、Gly（糖肽类，glycopeptides）、MLS（大环内酯类-林可酰胺类-链阳菌素类，macrolide-lincosamide-streptogramin）、Phe（苯丙醇类，phenicols）以及Tet（四环素类，tetracyclines）。（文件格式：XLS，大小约39 KB）