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Output files of RepeatModeler2

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DataCite Commons2022-05-27 更新2024-07-29 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Output_files_of_RepeatModeler2/19189004/1
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资源简介:
Output files (fasta file and stk file) of RepeatModeler2.Out files of family consensus files of transposable elements by RepeatMolder2. {abbreviaision of <i>Apis </i>species}.fa and {abbreviaision of<i> Apis </i>species}.stk contain consensus sequences with meta data describing transposable element families. Nomenclature of them is shown in Storer et al., 2021 (DOI: 10.1186/s13100-020-00230-y).

本数据集包含RepeatModeler2的输出文件,具体为FASTA格式文件与STK格式文件。其中,由RepeatModeler2生成的转座因子(transposable elements)家族一致性序列文件为:{蜜蜂属(Apis)物种缩写}.fa 与 {蜜蜂属(Apis)物种缩写}.stk。上述文件存储带有元数据的一致性序列,该元数据用于描述转座因子家族的相关信息。该数据集的命名规范详见Storer等于2021年发表的研究(DOI: 10.1186/s13100-020-00230-y)。
提供机构:
figshare
创建时间:
2022-04-20
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