S5-LP_annots_and_locations_full.xlsx

<strong>Table S5 | </strong>Annotations and genomic locations of <em>L. paranigra </em>transcripts (all BLAST hits). Column headers are defined as follows; <em>transcript: </em>transcript identifier, <em>scaffold</em>: scaffold to which the transcript maps, <em>start: </em>genomic location of start of transcript, <em>stop</em>: genomic location of end of transcript, <em>direction</em>: indicator of which direction the transcript is transcribed in, <em>Entry_Name</em>: Uniprot ID assigned to transcript, <em>Protein_Name</em>: Protein name associated with Uniprot_ID, <em>Gene_Name</em>: Gene names associated with Uniprot_ID, <em>Gene_Ontology_IDs</em>: GO IDs associated with Uniprot_ID, <em>pident</em>: percentage of identical matches, <em>length: </em>length (in bp) of sequence overlap, <em>mismatch</em>: number of mismatches, <em>gapopen</em>: number of gap openings, <em>qstart</em>: start of alignment in query, <em>qend</em>: end of alignment in query, <em>sstart:</em> start of alignment in subject, <em>send</em>: end of alignment in subject, <em>evalue</em>: expect value, <em>bitscore</em>: bit score.

补充表S5 | 副暗拟酵母（L. paranigra）转录本的注释信息与基因组定位（所有基本局部比对搜索工具（Basic Local Alignment Search Tool，BLAST）比对命中结果）。
各列表头定义如下：
转录本（transcript）：转录本标识符；
支架序列（scaffold）：转录本所比对的基因组支架序列；
起始位点（start）：转录本起始位置的基因组坐标；
终止位点（stop）：转录本终止位置的基因组坐标；
转录方向（direction）：用于指示转录本转录方向的标识；
条目名称（Entry_Name）：分配给该转录本的通用蛋白质资源（Universal Protein Resource，UniProt）编号；
蛋白质名称（Protein_Name）：与UniProt编号关联的蛋白质名称；
基因名称（Gene_Name）：与UniProt编号关联的基因名称；
基因本体标识符（Gene_Ontology_IDs）：与UniProt编号关联的基因本体（Gene Ontology，GO）编号；
序列一致性百分比（pident）：比对序列的一致碱基百分比；
比对长度（length）：序列重叠区域的长度（单位：碱基对，bp）；
错配数（mismatch）：比对中的错配碱基数目；
空位开放数（gapopen）：比对中空位开放的数目；
查询序列比对起始位点（qstart）：比对在查询序列中的起始位置；
查询序列比对终止位点（qend）：比对在查询序列中的终止位置；
靶序列比对起始位点（sstart）：比对在靶序列中的起始位置；
靶序列比对终止位点（send）：比对在靶序列中的终止位置；
期望值（evalue，即E值）：BLAST比对的统计期望阈值；
比特得分（bitscore）：比对的比特分值。