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Additional file 1: of An efficient method for protein function annotation based on multilayer protein networks

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DataCite Commons2024-12-16 更新2024-07-25 收录
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Supplementary Data are available, including Complexes.txt: The CYC2008 dataset, which consists of 408 protein complexes involving 1492 proteins in the yeast PPI network. DIP141001.txt: The DIP dataset, updated to Oct.1, 2014, consists of 5017 proteins and 23115 interactions among the proteins. Domain.txt: The domain data derived from Pfam database, including 1107 different types of domains among 3056 proteins. FP-MPN.exe: The FP-MPN algorithm. FPMPN.txt: The predicted results by FP-MPN. GO_C.txt, GO_F.txt and GO_P.txt: Represents cellular component (CC), molecular function (MF) and biological process (BP), respectively. (ZIP 437 kb)

本研究附带补充数据,包含以下文件: Complexes.txt:CYC2008数据集,涵盖酵母蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction, PPI)网络中的408个蛋白质复合物,涉及1492个蛋白质。 DIP141001.txt:更新至2014年10月1日的DIP数据集,包含5017个蛋白质及其间的23115条蛋白质相互作用。 Domain.txt:源自Pfam数据库的结构域(Domain)数据,涵盖3056个蛋白质中的1107种不同结构域。 FP-MPN.exe:FP-MPN算法程序。 FPMPN.txt:FP-MPN算法的预测结果。 GO_C.txt、GO_F.txt与GO_P.txt:分别对应细胞组分(Cellular Component, CC)、分子功能(Molecular Function, MF)以及生物过程(Biological Process, BP)。 (压缩包大小:437 KB)
提供机构:
Figshare
创建时间:
2017-12-19
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