BIGSdb-Pasteur

BIGSdb-Pasteur hosts a collection of curated multilocus sequence typing (MLST), whole-genome based typing (core genome cgMLST) and supplementary schemes (antimicrobial resistance, virulence, ...) for bacterial pathogens of public health importance, including Klebsiella pneumoniae and Listeria monocytogenes.BIGSdb-Pasteur 数据库收录了一套经人工整理的分型方案集，涵盖针对公共卫生重点关注细菌性病原体的多位点序列分型（MLST）、全基因组分型（核心基因组cgMLST）以及抗菌药物耐药性、毒力等补充分型方案，涉及的病原体包括肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）与单核细胞增生李斯特菌（Listeria monocytogenes）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

BIGSdb-Pasteur数据集专注于Bordetella细菌的基因型数据，基于多基因座序列分型（MLST）和核心基因组MLST（cgMLST）方法。它提供数据库访问、数据提交指南和相关资源，以支持公共健康重要病原体的研究。