Supplemental Material for Iwanicki et al., 2021
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资源简介:
<b>Additional file 1. </b>R script used to generate the phylogenetic tree. ; <b>Additional file 2. </b>Table S1.<b> </b>Main assembly summary assessed with QUAST tool in four de novo assemblers used to reconstruct the genome of <i>Metarhizium humberi</i> ESALQ1638.Table S2. The Geographical origin and host/substrate from each <i>Metarhizium </i>strain; <b>Additional file 3. </b>Table S2. List of repetitive elements in the genome of <i>Metarhizium humberi</i> ESALQ1638; <b>Additional file 4. </b>Table S3. List of repetitive elements in <i>Metarhizium</i> genomes; <b>Additional file 5. </b>Table S4. InterPro categories related to transcription factors; <b>Additional file 6. </b>Table S5. InterProScan analysis and comparison of <i>Metarhizium humberi</i> ESALQ1638 with other 10 <i>Metarhizium</i> genomes and outgroups. ; <b>Additional file 7. </b>Figure S1. Pipeline for analysis of <i>M. humberi </i>ESALQ1638. ; <b>Additional file 8. </b>tRNAscan analyses. ; <b>Additional file 9.</b> Orthologous genes 1.; <b>Additional file 10. </b>Orthologous genes 2. ; <b>Additional file 11.</b> InterPro category.; <b>Additional file 12.</b> Unique proteins <i>Metarhizium humberi</i> ESALQ1638.; <b>Additional file 13.</b> Enriched molecular function in <i>Metarhizium humberi</i> ESALQ1638 without orthologs in another genome sequenced of <i>Metarhizium</i>.; <b>Additional file 14.</b> Figure S1. Pipeline for analysis of <i>Metarhizium humberi</i> ESALQ1638 secretome. <b>Additional file 15. </b>Secretome.; <b>Additional file 16.</b> Pathogen-host interaction (PHI) dataset.
附加文件1. 用于构建系统发育树的R脚本。
附加文件2. 表S1:采用QUAST工具对4款用于重构亨伯尔绿僵菌(Metarhizium humberi)ESALQ1638基因组的从头组装软件的组装质量主汇总结果;表S2:各绿僵菌(Metarhizium)菌株的地理起源与宿主/基质信息。
附加文件3. 表S2:亨伯尔绿僵菌(Metarhizium humberi)ESALQ1638基因组中的重复序列列表。
附加文件4. 表S3:绿僵菌属(Metarhizium)基因组中的重复序列列表。
附加文件5. 表S4:与转录因子相关的InterPro分类条目。
附加文件6. 表S5:亨伯尔绿僵菌ESALQ1638与其他10株绿僵菌基因组及外类群的InterPro扫描分析与比较结果。
附加文件7. 图S1:亨伯尔绿僵菌ESALQ1638的分析流程。
附加文件8. tRNA扫描分析结果。
附加文件9. 直系同源基因集1。
附加文件10. 直系同源基因集2。
附加文件11. InterPro分类条目。
附加文件12. 亨伯尔绿僵菌ESALQ1638的特有蛋白质组。
附加文件13. 亨伯尔绿僵菌ESALQ1638中无其他已测序绿僵菌基因组直系同源基因的富集分子功能条目。
附加文件14. 图S1:亨伯尔绿僵菌ESALQ1638分泌组分析流程。
附加文件15. 分泌组数据。
附加文件16. 病原-宿主互作(Pathogen-Host Interaction, PHI)数据集。
提供机构:
GSA Journals
创建时间:
2021-12-01



