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Fungia scutaria de novo transcriptome assembly v1.0

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DataONE2015-09-21 更新2024-06-27 收录
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An annotated de novo transcriptome assembly produced from aposymbiotic planula larvae of Fungia scutaria on Coconut Island, HI, USA. Sequences were pre-processed to exclude low quality or uninformative reads, then assembled using Trinity. The raw data used to produce this assembly can be found at NCBI's SRA, accession number SRP063463. The assembly can be searched by gene name or functional terms using the following database: http://ib.oregonstate.edu/~meyere/DB/Fscu/search.php.

本数据集为基于美国夏威夷州椰子岛的盘形蕈珊瑚(Fungia scutaria)无共生体浮浪幼体构建的注释版从头转录组组装结果。所有测序序列经预处理以剔除低质量及无信息的测序读段,随后使用Trinity软件完成组装。本组装所用的原始数据可于美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)的序列读取档案(Sequence Read Archive, SRA)中获取,登录编号为SRP063463。用户可通过以下数据库,以基因名称或功能术语为检索条件对该组装结果进行查询:http://ib.oregonstate.edu/~meyere/DB/Fscu/search.php。
创建时间:
2015-09-21
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