Benchmark datasets and Script for DeepEukFinder
收藏DataCite Commons2023-09-03 更新2024-08-18 收录
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batch_predict_def.sh: script to get results from the test files, usage: (after environment is set to have DeepEukFinder in PATH) bash batch_predict_def.sh.test-data.zip: 20 benchmark datasets for DeepEukFinder. The name of each file"a_b_c_d_e_test.fasta"a: number of prokaryotesb: number of prokaryotic-virusesc: number of plasmidsd: number of eukaryotese: number of eukaryotic-viruses<br><br>
`batch_predict_def.sh`:用于从测试文件获取预测结果的脚本,使用方法为:(需先将DeepEukFinder配置至系统PATH环境变量中)执行`bash batch_predict_def.sh`。
`test-data.zip`:包含20个用于DeepEukFinder的基准测试数据集。各文件的命名格式为"a_b_c_d_e_test.fasta",其中:
a 代表原核生物的数量,b 代表原核病毒的数量,c 代表质粒的数量,d 代表真核生物的数量,e 代表真核病毒的数量。
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2023-09-03



