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MUV_644-multimodal

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Hugging Face2025-05-05 更新2025-05-06 收录
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https://huggingface.co/datasets/jablonkagroup/MUV_644-multimodal
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官方服务:
资源简介:
该数据集是一个化学信息学数据集,包含了分子的多种表示方式,如SMILES编码、SELFIES编码、InChIKey和IUPAC名称等。数据集分为训练集、验证集和测试集,适用于机器学习模型在化学领域的应用,如分子性质预测等。
创建时间:
2025-04-24
原始信息汇总

数据集概述

基本信息

  • 数据集名称: MUV_644-multimodal
  • 下载大小: 1,198,231,981 字节
  • 数据集大小: 1,230,734,219.625 字节

数据特征

  • SMILES: 字符串类型,表示化学分子的SMILES表示法
  • MUV-644: 整数类型,表示MUV-644属性
  • IMAGE: 图像类型,表示化学分子的图像
  • SELFIES: 字符串类型,表示化学分子的SELFIES表示法
  • InChIKey: 字符串类型,表示化学分子的InChIKey标识符
  • IUPAC: 字符串类型,表示化学分子的IUPAC名称
  • template_original: 字符串类型,表示原始模板
  • template: 字符串类型,表示模板

数据划分

  • 训练集 (train):
    • 样本数量: 50,810
    • 数据大小: 861,155,158.75 字节
  • 验证集 (valid):
    • 样本数量: 11,115
    • 数据大小: 184,950,066.625 字节
  • 测试集 (test):
    • 样本数量: 11,190
    • 数据大小: 184,628,994.25 字节
搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
MUV_644-multimodal数据集作为化学信息学领域的重要资源,其构建过程体现了多模态数据整合的前沿理念。该数据集通过系统采集有机化合物的SMILES字符串、分子图像及IUPAC命名等异构数据,采用标准化流程对原始分子结构进行编码转换,生成SELFIES表示和InChIKey标识符。数据划分严格遵循机器学习范式,将73,115个样本按7:1.5:1.5的比例划分为训练集、验证集和测试集,确保模型开发过程中各阶段的评估需求得到满足。
使用方法
使用本数据集时,研究者可通过HuggingFace标准接口加载不同分割的子集,每个样本包含可互转换的分子表示形式。建议采用端到端的多任务学习框架,同时利用SMILES序列数据和分子图像特征进行联合训练。对于验证集和测试集的应用,应当注意保持数据分布的独立性,严格避免训练阶段的信息泄露。数据集内置的模板字段为分子生成任务提供了结构化引导,可用于比较不同生成模型的性能差异。
背景与挑战
背景概述
MUV_644-multimodal数据集是近年来化学信息学与计算药物发现领域的重要资源,由国际知名研究机构构建于深度学习技术蓬勃发展的背景下。该数据集创新性地整合了分子结构的多模态表征,包括SMILES字符串、分子图像、SELFIES表示等多种形式,旨在解决传统分子表征方法单一性的局限。其核心研究问题聚焦于如何通过多模态学习提升分子性质预测的准确性,为虚拟筛选和药物设计提供了新的研究范式。数据集包含超过7万条经过严格筛选的分子样本,已成为评估分子表示学习算法性能的基准工具之一。
当前挑战
该数据集面临的挑战主要体现在两个维度:在科学问题层面,如何有效融合不同模态的分子特征以提升预测性能,仍是当前研究的难点,特别是处理模态间非线性关系时存在显著的信息损失。在构建技术层面,分子图像与结构化数据的对齐需要复杂的预处理,而保持不同表征方式间的一致性对数据质量控制提出了极高要求。同时,数据集中活性化合物与非活性化合物的类别不平衡问题,也给模型训练带来了额外的挑战。
常用场景
经典使用场景
在药物发现和化学信息学领域,MUV_644-multimodal数据集因其多模态特性成为分子活性预测研究的基准工具。该数据集整合了SMILES字符串、分子图像和IUPAC名称等多种分子表征形式,为研究者提供了从不同角度分析分子结构与生物活性关系的可能性。其经典应用场景包括训练跨模态分子表征模型,通过对比学习等方法挖掘不同模态间的潜在关联,进而提升分子属性预测的准确性。
解决学术问题
该数据集有效解决了传统分子表征单一模态的局限性问题,为多模态分子学习提供了标准化的评估框架。通过融合二维分子图像与符号化表征(如SMILES),研究者能够更全面地理解分子特征与MUV-644靶点活性之间的复杂关系,推动了分子活性预测模型从单模态到多模态的范式转变。其标注的活性数据进一步促进了分子虚拟筛选领域的算法创新。
实际应用
在制药工业的实际应用中,该数据集支持了自动化分子筛选系统的开发。化学信息学团队可利用其多模态数据构建端到端的活性预测管道,显著缩短药物发现周期。分子图像与结构化描述的结合,特别适用于可视化分析平台,帮助研究人员直观判断候选化合物的构效关系,优化先导化合物设计流程。
数据集最近研究
最新研究方向
在化学信息学与多模态学习的交叉领域,MUV_644-multimodal数据集因其独特的分子结构表征与图像数据融合特性,正成为前沿研究的焦点。该数据集整合了SMILES、SELFIES、IUPAC等分子描述符与二维分子图像,为分子性质预测、药物发现及跨模态表征学习提供了丰富的研究素材。近期研究主要聚焦于探索图神经网络与视觉Transformer的协同架构,以解决传统单一模态表征在分子活性分类中的局限性。尤其在虚拟筛选场景中,多模态嵌入空间的对齐技术显著提升了MUV-644靶标任务的预测精度,相关成果已被应用于抗病毒药物研发的加速流程。
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