Additional file 1: Table S1. of Relationships between gut microbiota, plasma metabolites, and metabolic syndrome traits in the METSIM cohort

List of measured traits. Table S2. Relative abundances of detected taxonomy across 531 METSIM subjects. Table S3. Relative abundances of detected OTUs across 531 METSIM subjects. Table S4. Association of 37 traits with Brayâ Curtis distance (FDR <0.1). Table S5. Association with OTU richness and Shannonâ s diversity index. Table S6. The significant associations with individual OTUs (FDR <0.1). Table S7. The significant associations with individual taxons (FDR <0.1). Table S8. Spearman correlations of acetate with 59 traits. Table S9. Spearman correlations of TMAO with 59 traits. Table S10. WGCNA modules and the list of OTUs in each module. Table S11. Representation of taxonomy in each WGCNA module. Table S12. Characteristics of individuals based on the OGTT. Table S13. Representation of taxonomy in each WGCNA modules in subjects with NGT and pre-T2D. (XLSX 3213 kb)

已测量性状列表。
表S2：531名METSIM受试者中检测到的分类群相对丰度。
表S3：531名METSIM受试者中检测到的操作分类单元（Operational Taxonomic Unit, OTU）相对丰度。
表S4：37个性状与布莱里-柯蒂斯距离（Bray-Curtis distance）的关联分析（错误发现率（False Discovery Rate, FDR）<0.1）。
表S5：与操作分类单元丰富度及香农多样性指数（Shannon’s diversity index）的关联分析。
表S6：与单个操作分类单元的显著关联分析（FDR<0.1）。
表S7：与单个分类群的显著关联分析（FDR<0.1）。
表S8：乙酸盐与59个性状的斯皮尔曼相关性分析。
表S9：氧化三甲胺（Trimethylamine N-oxide, TMAO）与59个性状的斯皮尔曼相关性分析。
表S10：加权基因共表达网络分析（Weighted Gene Co-expression Network Analysis, WGCNA）模块及各模块内的操作分类单元列表。
表S11：各WGCNA模块中的分类群占比情况。
表S12：基于口服葡萄糖耐量试验（Oral Glucose Tolerance Test, OGTT）的受试者特征。
表S13：糖耐量正常（Normal Glucose Tolerance, NGT）及前驱2型糖尿病（pre-type 2 diabetes, pre-T2D）受试者各WGCNA模块中的分类群占比情况。（XLSX格式，文件大小3213 kb）