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AviList Global Avian Checklist

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github2025-06-18 更新2025-06-19 收录
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https://github.com/dalyanalytics/avilistr
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官方服务:
资源简介:
AviList代表鸟类学的一个里程碑成就——第一个统一的地球鸟类物种全球清单。它包含了11,131个物种、19,879个亚种、252个科和46个目,统一了IOC、Clements和BirdLife之间的分类差异,并包含了丰富的元数据。

AviList represents a milestone achievement in ornithology—the first unified global checklist of bird species. It encompasses 11,131 species, 19,879 subspecies, 252 families, and 46 orders, harmonizing the classification discrepancies between IOC, Clements, and BirdLife, and includes extensive metadata.
创建时间:
2025-06-12
原始信息汇总

AviList全球鸟类名录数据集概述

数据集简介

  • 名称: AviList Global Avian Checklist
  • 描述: 首个统一全球鸟类分类名录,整合了IOC、Clements和BirdLife名录的差异
  • 版本: 2025年6月发布
  • 访问方式: 通过R包avilistr提供

数据内容

  • 物种数量: 11,131种
  • 属数量: 2,376个
  • 亚种数量: 19,879个
  • 科数量: 252个
  • 目数量: 46个

主要数据集

  1. avilist_2025

    • 记录数: 33,685
    • 字段数: 26
    • 描述: 包含所有可用字段的完整数据集
  2. avilist_2025_short

    • 记录数: 33,685
    • 字段数: ~12
    • 描述: 仅包含基本分类字段
  3. avilist_metadata

    • 记录数: 26
    • 字段数: 6
    • 描述: 字段描述和元数据

关键字段

  • Scientific_name: 学名
  • English_name_AviList: AviList官方英文名
  • English_name_Clements_v2024: Clements英文名
  • Order, Family: 分类学分类
  • Authority: 原始描述作者和年份
  • Taxon_rank: 物种、亚种等
  • AvibaseID: Avibase数据库链接

应用场景

  1. 科学研究

    • 分类学研究
    • 生物多样性分析
    • 保护规划
    • 系统发育研究
  2. 观鸟与公民科学

    • 名录标准化
    • 物种验证
    • 分布区验证
    • 旅行规划
  3. 数据管理

    • 数据库清理
    • API集成
    • 报告生成
    • 质量控制

安装与使用

  • CRAN安装: r install.packages("avilistr")

  • GitHub安装: r devtools::install_github("dalyanalytics/avilistr")

引用

  • R包引用: r citation("avilistr")

  • AviList数据引用:

    AviList Core Team. 2025. AviList: The Global Avian Checklist, v2025. https://doi.org/10.2173/avilist.v2025

许可证

  • R包: CC0 License (公共领域)
  • AviList数据: CC BY 4.0
搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
AviList全球鸟类名录数据集代表了鸟类分类学的重大突破,其构建过程体现了多源数据融合的前沿方法。该数据集通过整合国际鸟类学联盟(IOC)、克莱门茨(Clements)和鸟类生命国际(BirdLife)三大权威名录的差异,采用先进的分类学调和算法,建立了包含11,131个物种、19,879个亚种的统一分类体系。数据集构建过程中特别注重元数据的完整性,每个记录包含26个字段的丰富信息,从学名、俗名到分类层级和原始描述作者等细节一应俱全。
特点
作为首个全球统一的鸟类分类名录,AviList数据集最显著的特点是实现了不同分类体系间的标准化映射。数据集不仅提供完整的分类学信息,还包含与Avibase等外部数据库的链接字段,极大地方便了跨数据库研究。其数据架构设计兼顾了全面性和灵活性,既提供包含全部26个字段的完整版本,也提供仅含关键字段的精简版本,满足不同研究场景的需求。数据集的另一个突出优势是其时效性,2025年版本反映了最新的分类学研究进展。
使用方法
该数据集通过R语言包avilistr提供便捷的访问方式,用户可通过简单的install.packages命令完成安装。数据集支持多种应用场景:研究人员可利用完整版数据进行生物多样性分析或系统发育研究;观鸟爱好者可通过数据集实现不同名录体系的转换;数据库管理员则可借助该数据集进行物种名称标准化处理。数据集特别设计了metadata表辅助字段理解,并提供了详细的在线文档说明。无论是通过data()函数加载完整数据,还是使用特定字段进行筛选分析,都能获得流畅的使用体验。
背景与挑战
背景概述
AviList Global Avian Checklist作为鸟类学领域的重要里程碑,由国际鸟类学家联盟协调的鸟类名录工作组于2025年6月正式发布。该数据集整合了IOC、Clements和BirdLife三大权威鸟类分类系统的差异,首次建立了全球统一的鸟类分类标准。涵盖11,131个物种、19,879个亚种以及252个科的系统化数据,为生物多样性研究、物种保护规划和系统发育分析提供了标准化的分类框架。这一开创性工作由AviList核心团队主导,得到了鸟类生命国际、康奈尔鸟类学实验室等机构的支持,显著提升了全球鸟类分类数据的互操作性和科研价值。
当前挑战
在解决鸟类分类系统碎片化这一核心问题时,AviList面临着多重挑战:如何有效调和不同分类体系在物种划分、命名规则和系统发育关系上的显著差异;如何处理分类学权威机构间持续变动的分类标准。数据集构建过程中,研究人员需要克服数据异构性问题,包括拉丁学名拼写变异、同物异名整合,以及跨数据库标识符匹配等技术难题。此外,保持与快速演化的分类学进展同步更新,确保全球鸟类名录的时效性和准确性,也是该数据集持续维护的关键挑战。
常用场景
经典使用场景
在鸟类学研究领域,AviList Global Avian Checklist数据集作为首个统一全球鸟类分类清单,为研究者提供了标准化的物种分类框架。该数据集最经典的使用场景包括进行全球鸟类多样性分析、物种分布模式研究以及跨数据库分类学比对。通过整合IOC、Clements和BirdLife三大权威清单的差异,研究者能够基于统一标准开展物种丰富度评估和系统发育分析。
衍生相关工作
基于该数据集衍生的经典工作包括开发跨数据库分类转换工具和自动化物种识别系统。Cornell鸟类学实验室将其整合至Merlin识别应用中,BirdLife International则建立了与IUCN红色名录的自动映射接口。此外,多篇发表于《Ibis》等期刊的宏生态学研究均以该数据集作为核心分类基准。
数据集最近研究
最新研究方向
随着全球生物多样性保护需求的日益增长,AviList Global Avian Checklist作为首个统一全球鸟类分类学的标准化数据集,正在推动鸟类学研究范式的转变。该数据集整合了IOC、Clements和BirdLife三大权威分类系统的差异,为物种界定和系统发育研究提供了前所未有的标准化框架。当前研究热点集中在利用这一统一分类体系开展跨数据库的生物多样性评估、保护优先区规划以及气候变化对鸟类分布的影响分析。在技术应用层面,研究者正探索如何将AviList与eBird等公民科学平台深度整合,以提升观测数据的科学价值。该数据集的出现,有效解决了长期以来因分类标准不统一导致的物种统计偏差问题,为全球鸟类保护政策的制定提供了可靠的数据支撑。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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