The Reconstruction of 2,631 Draft Metagenome-Assembled Genomes from the Global Oceans
收藏DataCite Commons2020-09-01 更新2024-07-25 收录
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资源简介:
Data for 2,631 draft genomes (TOBG-GENOMES.tar.gz) generated using the Tara Oceans microbial metagenomic data sets - additionally includes:SECONDARY_CONTIGS.province.tar.gz -- SECONDARY contigs by provinceTOBG-READCOUNT.tar.gz -- read count values of each sample against SECONDARY contigsTOBG-BINS.tar.gz -- genome bins <50% complete (15,557 bins with >5 contigs)PRIMARY_CONTIGS.province.tar.gz -- PRIMARY contigs by province and sampleLarger files have been split - to restore the full tar ball, use cat to combine. E.G. cat PRIMARY_CONTIGS.MEDITERRANEAN0* > PRIMARY_CONTIGS.MEDITERRANEAN.tar.gz cat And then decompressIndian Monsoon = 1 filesArabian Sea = 1 fileRed Sea = 1 fileMediterranean = 2 filesEast Africa Coastal = 2 filesChile-Peru Coastal = 2 filesNorth Pacific = 2 filesNorth Atlantic = 4 filesSouth Atlantic = 4 filesSouth Pacific = 7 files
本数据集包含基于塔拉海洋(Tara Oceans)微生物宏基因组数据集构建的2631份草图基因组数据(TOBG-GENOMES.tar.gz),此外还涵盖以下内容:
SECONDARY_CONTIGS.province.tar.gz:按省份划分的二级重叠群(contigs)数据
TOBG-READCOUNT.tar.gz:各样本比对至二级重叠群的读段计数结果
TOBG-BINS.tar.gz:完整度低于50%的基因组分箱(bins)数据(共15557个分箱,每个分箱包含≥5条重叠群)
PRIMARY_CONTIGS.province.tar.gz:按省份和样本划分的一级重叠群(contigs)数据
部分体积较大的文件已拆分,如需恢复完整压缩包,请使用cat命令合并。例如:cat PRIMARY_CONTIGS.MEDITERRANEAN0* > PRIMARY_CONTIGS.MEDITERRANEAN.tar.gz,随后执行解压操作。
各研究区域对应的文件数量如下:
印度季风区:1个文件
阿拉伯海:1个文件
红海:1个文件
地中海:2个文件
东非沿海:2个文件
智利-秘鲁沿海:2个文件
北太平洋:2个文件
北大西洋:4个文件
南大西洋:4个文件
南太平洋:7个文件
提供机构:
figshare
创建时间:
2017-09-29



