Klassifikations- und Konsistenzprüfungs-Datensatz zu 71 GHK-Cu-modulierten Genen (Pickart & Margolina 2018) — Begleitdaten zur Bachelorarbeit "Genexpressionsdaten als digitale Informationsgrundlage zur Charakterisierung und Einordnung regenerativer Wirkmechanismen — eine literaturbasierte Analyse am Beispiel von GHK-Cu"

Reproduzierbarer Begleitdatensatz zur Bachelorarbeit „Genexpressionsdaten als digitale Informationsgrundlage zur Charakterisierung und Einordnung regenerativer Wirkmechanismen: eine literaturbasierte Analyse am Beispiel von GHK-Cu" HINTERGRUND: Pickart & Margolina (2018) berichten 71 durch GHK-Cu regulierte Gene und ordnen jedes Gen einem von drei funktionalen Systemen zu: Nervensystem (Tab. 2, 20 Gene), Ubiquitin-Proteasom-System (Tab. 3, 43 Gene) und Anti-Pain / Opioid-Signalgebung (Tab. 4, 8 Gene). VORGEHEN: Der Datensatz überprüft für jedes der 71 Gene, ob Pickarts Zuordnung nach aktuellem Wissensstand belegbar ist. Die Prüfung erfolgt auf zwei unabhängigen Wegen nach demselben Regelwerk (dokumentiert in Anhang B, im Deposit als PDF mitgeliefert): als manuelle Expert-Klassifikation und parallel als programmatische Klassifikation über ein Python-Skript (V4.2), das reproduzierbar per REST-API extrahierte Datenbank-Snapshots (Query 7./8. Juli 2026) auswertet. Grundlage sind vier Primärquellen: HGNC, NCBI Gene, UniProt und Reactome. Die Klassifikation folgt vier operationalisierten Informationsqualitäts-Dimensionen nach Wang & Strong (1996): Accuracy, Completeness, Concise Representation, Relevancy. Als unabhängige Zusatz-Validierung prüft eine Pathway-Enrichment-Analyse (g:Profiler) die funktionale Kohärenz der drei Pickart-Gruppen. AUSWERTUNG: Für die überwiegende Mehrheit der 71 Gene lässt sich Pickarts funktionale Zuordnung durch die aktuelle Datenbank-Realität bestätigen; die Pathway-Enrichment-Analyse untermauert zusätzlich die biologische Kohärenz der drei Gruppen. Die vollständigen Klassifikations-Ergebnisse pro Gen mit den vier IQ-Dimensionen, die Reliabilitäts-Kennzahlen des Vergleichs zwischen manueller und programmatischer Klassifikation sowie die Enrichment-Details finden sich in den mitgelieferten Dokumenten dieses Deposits (Anhang_B_Klassifikationsmatrix.pdf, Klassifikationsmatrix_71Gene_Dimensionen.xlsx, kappa_results_V4-2.json, gProfiler-CSVs). Die inhaltliche Interpretation und methodische Diskussion erfolgen zusätzlich in der zugehörigen Bachelorarbeit. INHALT: Rohdaten-Snapshot der REST-API-Extrakte (raw_snapshot_71genes.csv); vollständige Klassifikationsmatrix nach Wang & Strong mit Anhang-B-Detailkarten (PDF + XLSX); g:Profiler-Enrichment-Ergebnisse für alle drei Gruppen; V3-Extraktions-Skript und V4.2-Validierungs-Notebook mit gepinnten Abhängigkeiten (requirements.txt); vor-registriertes Regelwerk (SHA-256-integritätsgesichert) und vollständiger CHANGELOG; Abbildungs-Generierungs-Skript (ghkcu_enrichment_figures.py) mit Google-Colab-Notebook (Reproduce_Figures_Colab.ipynb) und den vier exportierten BA-Abbildungs-PNGs; F-UJI-basierte FAIR-Assessment-Reports für Datensatz und Primärquelle mit Kurz-Bericht (FAIR_Bericht.md). NACHNUTZUNG: Der Datensatz stellt eine aktuelle, FAIR-konforme Aufbereitung der 71 Pickart-Gene mit persistenten Identifiern (HGNC, NCBI, UniProt, Reactome) und reproduzierbaren Skripten bereit. Er eignet sich als Ausgangspunkt für weitergehende Analysen zu GHK-Cu-Wirkmechanismen in regenerativer Medizin, Neurodegeneration, Wundheilung und Anti-Aging-Forschung. ÄNDERUNGEN IN V2 (2026-07-24): Ergänzung um das Abbildungs-Generierungs-Skript ghkcu_enrichment_figures.py (04_Skripte/), ein begleitendes Google-Colab-Notebook (Reproduce_Figures_Colab.ipynb) zur browserbasierten Reproduktion ohne lokale Installation, die vier exportierten BA-Abbildungen als PNG-Dateien (05_Abbildungen/) sowie F-UJI-basierte FAIR-Assessment-Berichte für Datensatz und Primärquelle (06_FAIR_Assessment/, JSON-Reports vom 19.7.2026 mit Kurz-Bericht FAIR_Bericht.md). Die zugrunde liegenden Klassifikations- und Enrichment-Ergebnisse aus V1 (Kern-Ergebnis: 78,9 % Übereinstimmung, Cohen's Kappa 0,616) sind unverändert. Version 2 bringt keine Änderung an den wissenschaftlichen Ergebnissen; sie erweitert das Deposit um zusätzliche Reproduktions- und Assessment-Materialien. Lizenz: CC-BY 4.0. Zenodo-DOIs: V1 (2026-07-19): 10.5281/zenodo.21435503 · V2 (2026-07-24): 10.5281/zenodo.21529550. Die Bachelorarbeit zitiert den Deposit über die stabile Concept-DOI (siehe Zenodo-Versionshistorie).