Phylogenies reported in "Transcriptomics illuminates the invasive lifestyle of the salmon gut pathogen Spironucleus salmonicida"
收藏DataCite Commons2020-08-28 更新2024-07-27 收录
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资源简介：
Phylogenetic datasets for genes discussed in Stairs et al. (in prep).<br><br>Each zip file contains five files with the following suffixes.<br><br>*.fasta -- Dataset (taxa IDs and taxonomy are included in the fasta headers)<br>*.ma.fasta -- Mafft-linsi alignment<br>*.ma.bm.fasta -- Mafft-linsi alignment masked with BMGE<br>*.log -- IQTREE log file<br>*.treefile -- IQTREE tree file<br><br><br><br><br>
对应Stairs等人（待发表）研究中涉及的基因的系统发育数据集。
每个压缩包均包含五个后缀各异的文件，具体如下：
*.fasta：数据集（分类单元标识符与分类学信息均包含于FASTA文件头中）
*.ma.fasta：经Mafft-linsi比对得到的多序列比对文件
*.ma.bm.fasta：经Mafft-linsi比对后通过BMGE完成序列屏蔽的文件
*.log：IQTREE运行日志文件
*.treefile：IQTREE生成的系统发育树文件
提供机构：
figshare
创建时间：
2019-01-28
