Hardwood Genomics Project

This database serves forest tree scientists by providing online access to hardwood tree genomic and genetic data, including assembled reference genomes, transcriptomes, and genetic mapping information. The web site also provides access to tools for mining and visualization of these data sets, including BLAST for comparing sequences, Jbrowse for browsing genomes, Apollo for community annotation and Expression Analysis to build gene expression heatmaps.

本数据库旨在服务于森林树木学家，通过提供在线访问硬木树种基因组及遗传数据，包括组装的参考基因组、转录组和遗传图谱信息。网站还提供了挖掘和可视化这些数据集的工具，包括用于序列比较的BLAST、用于浏览基因组的Jbrowse、用于社区注释的Apollo以及用于构建基因表达热图的基因表达分析工具。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Hardwood Genomics Project是一个专注于硬木树基因组学的数据库，提供基因组、转录组和遗传图谱数据，并包含BLAST、Jbrowse等工具用于数据挖掘和可视化。该数据库由美国国家科学基金会和田纳西大学支持，数据开放获取，适用于森林树科学家的研究。