Indicateurs sur les variants Covid-19

Les analyses concernant les variants portent sur les données
relatives aux suspicions ou aux résultats de criblage suite à une PCR ou
un test antigénique (TA) positif.
Les données sont rapportées à l’ensemble des tests positifs réalisés (RT-PCR + TA),
et non à un nombre de personnes. En effet la définition des personnes
pour le calcul des indicateurs ne retient qu’un seul test pour une
personne dans une période donnée, alors que cette dernière peut s’être
fait tester plusieurs fois (test TA, suivi par un PCR par exemple) L’objectif de l’analyse de ces données est de suivre la circulation
sur le territoire des variants d’intérêt, qui concernent à ce jour les
variants :
Royaume-Uni (UK): code Nexstrain= 20I/501Y.V1Afrique du Sud (ZA) : code Nexstrain= 20H/501Y.V2Brésil (BR) : code Nexstrain= 20J/501Y.V3
Données par semaine glissante diffusées par département, région et france.
Les variables :
Semaine = Semaine glissante
cl_age90 = Classe d’âge
Nb_tests_PCR_TA_crible = Nombre de tests PCR criblés parmi les PCR positives
Prc_tests_PCR_TA_crible = % de tests PCR criblés parmi les PCR positives
Nb_susp_501Y_V1 = Nombre de tests avec suspicion de variant 20I/501Y.V1 (UK)
Prc_susp_501Y_V1 = % de tests avec suspicion de variant 20I/501Y.V1 (UK)
Nb_susp_501Y_V2_3 = Nombre de tests avec suspicion de variant 20H/501Y.V2 (ZA) ou 20J/501Y.V3 (BR)
Prc_susp_501Y_V2_3 = % de tests avec suspicion de variant 20H/501Y.V2 (ZA) ou 20J/501Y.V3 (BR)
Nb_susp_IND = Nombre de tests avec une détection de variant mais non identifiable
Prc_susp_IND = % de tests avec une détection de variant mais non identifiable
Nb_susp_ABS = Nombre de tests avec une absence de détection de variant
Prc_susp_ABS = % de tests avec une absence de détection de variantLes classes d’âge :
• 0 tous âges
• 09 0-9 ans
• 19 10-19 ans
• 29 20-29 ans
• 39 30-39 ans
• 49 40-49 ans
• 59 50-59 ans
• 69 60-69 ans
• 79 70- 79 ans
• 89 80-89 ans
• 90 90 ans et plus