Metabuli GTDB database part 1
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Metabuli GTDB Database (Version 214.1) PART 1 The Metabuli GTDB database is a pre-built database based on the Genome Taxonomy Database (GTDB) genomes and taxonomy. This database is divided into two parts due to its large size (greater than 50 GB), so please download PART 2 in the same directory. PART 2: 10.5281/zenodo.12207188 Database Specifications GTDB Version: 214.1 Genome Quality Control (QC): Assembly Level: Complete Genome or Chromosome level assemblies Completeness: CheckM completeness > 90% Contamination: CheckM. contamination < 5% Usage Put the files downloaded from PART 1 and PART 2 in the same directory. `gzip -d` for `info.gz` from PART1 and `diffIdx.gz` from PART2. The directory is now DBDIR for `classify` module.
Metabuli GTDB 数据库(版本214.1) 第一部分 Metabuli GTDB数据库是基于基因组分类数据库(Genome Taxonomy Database, GTDB)的基因组与分类学信息构建的预构建数据库。由于该数据库体量超过50 GB,体积较大,因此分为两个部分,请在同一目录下下载第二部分。 第二部分:10.5281/zenodo.12207188 数据库规格 GTDB版本:214.1 基因组质量控制(QC): 组装水平:完成基因组或染色体级组装 完整度:CheckM完整度>90% 污染率:CheckM污染率<5% 使用方法 将从第一部分和第二部分下载的文件放置于同一目录中。 对第一部分的`info.gz`以及第二部分的`diffIdx.gz`执行`gzip -d`命令进行解压。 此时该目录即可作为`classify`模块的`DBDIR`目录。



