SCAN
收藏知名数据库2026-06-11 收录
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SCAN is the first neural database that combines single cell transcriptome and spatial transcriptome data, covering 10,679,684 cells from 960 species and 880 data sets generated by 26 single cell sequencing techniques. In addition, SCAN also covers 477 spatial transcriptome datasets including brain, retina, spinal cord, and embryos, and over 100 neurological diseases.
SCAN是首个整合单细胞转录组（single cell transcriptome）与空间转录组（spatial transcriptome）数据的神经科学数据库，其覆盖了来自960个物种的10,679,684个细胞，以及由26种单细胞测序技术（single cell sequencing techniques）生成的880套数据集。此外，SCAN还涵盖477套空间转录组数据集，涉及大脑、视网膜、脊髓与胚胎组织，同时包含超过100种神经系统疾病（neurological diseases）的相关数据。
提供机构：
中国医学科学院北京协和医学院搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
SCAN是首个整合单细胞转录组与空间转录组数据的神经细胞数据库，涵盖来自960个物种的超过1000万个细胞、880个数据集，并涉及477个空间转录组数据集及100多种神经系统疾病。该数据库还提供多种分析和可视化工具，用于神经细胞类型分类、进化发育和疾病研究，为神经科学领域提供全面的资源支持。
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