杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-11-01 更新2024-03-06 收录
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资源简介：
系统进化树分析表明，ClNAC1 蛋白位于B 分支，与拟南芥的NST1 /2 /3、毛果杨的PtrWND2A/B 等聚在一起，属于次生生长相关的NAC 转录因子类别。利用来自6 个地理种源的40 个无性系发现ClNAC1 内存在104 个常见SNP 位点，平均发生频率为1 /24 bp，多样性水平达到0. 012 53。编码区域有32个SNP 位点，其中25 个属于同义突变，7个属于错义突变。SNP 多样性指数πtot、πsil、πs、πn在6 个群体间的差异不显著，且不同群体的非同义突变多样性πn皆小于同义突变多样性πs。LD 分析显示，当r2 ＞ 0. 1 时，在6 个群体中LD 衰退序列长度在1 025-2 460 bp 间变化，在基因内部LD 水平已衰退至不显著。杉木ClNAC1 基因可能参与次生壁的发育。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2022-11-01
