Rhodopseudomonas palustris TIE-1

Tilt Series Date: 2012-05-09 Data Taken By: Alasdair McDowall Species / Specimen: Rhodopseudomonas palustris Strain: None Tilt Series Settings: Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1°, constant angular increment, dosage: 100.0 eV/Ų, defocus: None μm, magnification: 22500x. Acquisition Software: UCSFTomo Upload Method: pipeline Processing Software Used: raptor Collaborators and Roles: Nicholas ShikumaDianne Newman Purification / Growth Conditions / Treatment: wild type and shc mutantgrown by photoheterotrophic anaerobic exponential and stationary Sample Preparation: vitrobot amw2012-05-09-9_slicer4822.jpg: unknown amw2012-05-09-9_slicer4823.jpg: Granules amw2012-05-09-9_slicer4824.jpg: Granules amw2012-05-09-9_slicer4826.jpg: unknown vesicles amw2012-05-09-9_slicer4827.jpg: unknown vesicles

倾斜序列采集日期：2012年5月9日
数据采集者：阿拉斯代尔·麦克道尔（Alasdair McDowall）
物种/标本：沼泽红假单胞菌（Rhodopseudomonas palustris）
菌株：无
倾斜序列采集参数：单轴倾斜，倾斜范围为(-60.0°, 60.0°)，步长1°，采用恒定角度增量，电子辐照剂量为100.0 eV/Ų，散焦值：未设置（μm），放大倍数：22500倍
采集软件：UCSFTomo
上传方式：流水线（pipeline）
所用数据处理软件：raptor
合作者及职责：尼古拉斯·希库马（Nicholas Shikuma）、黛安娜·纽曼（Dianne Newman）
纯化/培养条件/处理方式：野生型及shc突变株，经光异养厌氧培养至指数生长期与稳定生长期
样本制备及对应图像信息：
amw2012-05-09-9_slicer4822.jpg：未知样本
amw2012-05-09-9_slicer4823.jpg：细胞内含颗粒
amw2012-05-09-9_slicer4824.jpg：细胞内含颗粒
amw2012-05-09-9_slicer4826.jpg：未知囊泡
amw2012-05-09-9_slicer4827.jpg：未知囊泡

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是Rhodopseudomonas palustris TIE-1细菌的电子断层扫描倾斜系列数据，采集于2012年5月9日，使用单轴倾斜技术，范围从-60°到60°，步长1°，剂量为100.0 eV/Ų，放大22500倍。样本包括野生型和shc突变体，在光异养厌氧条件下生长，图像显示颗粒和未知囊泡结构，用于研究细菌的微观形态。