angaGEDUCI

We provide a publicly-accessible database and integrated data-mining tool, angaGEDUCI, that unifies 1) stage- and tissue-specific microarray analyses of gene expression in An. gambiae at different developmental stages and temporal separations following a bloodmeal, 2) functional gene annotation, 3) genomic sequence data, and 4) promoter sequence comparison algorithms. The database can be used to study genes expressed in particular stages, tissues, and patterns of interest, and to identify conserved promoter sequence motifs that may play a role in the regulation of such expression.本研究提供一款公开可访问的数据库与集成化数据挖掘工具angaGEDUCI，该工具整合了四类核心资源与算法：1）冈比亚按蚊（An. gambiae）在不同发育阶段及吸血后不同时间间隔下，特定发育阶段与组织的基因表达微阵列分析数据；2）基因功能注释信息；3）基因组序列数据；4）启动子序列比对算法。该数据库可用于探究特定发育阶段、组织及目标表达模式下的表达基因，同时可识别可能参与调控此类基因表达的保守启动子序列基序。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

angaGEDUCI是一个公开的数据库和集成数据挖掘工具，它整合了阶段和组织特异性微阵列分析、功能基因注释、基因组序列数据以及启动子序列比较算法。该数据库可用于研究特定发育阶段、组织或表达模式的基因，并识别可能调控表达的保守启动子序列基序。