SwissRegulon

The Swissregulon Database contains genome-wide annotations of regulatory sites. The predictions are based on Bayesian probabilistic analysis of a combination of input information including i) Experimentally determined binding sites reported in the literature, ii) Known sequence-specificities of transcription factors, iii) ChIP-chip and ChIP-seq data, iiii) Alignments of orthologous non-coding regions.瑞士调控组数据库（Swissregulon Database）收录了全基因组水平的调控位点注释信息。其预测结果基于对多源输入信息的贝叶斯概率分析，所整合的输入信息包括：i）文献中报道的实验验证结合位点；ii）已知的转录因子序列特异性；iii）染色质免疫沉淀芯片（ChIP-chip）与染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）数据；iv）同源非编码区域的序列比对结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

SwissRegulon是一个基因组范围调控位点注释数据库，其预测基于贝叶斯概率分析，整合了实验结合位点、转录因子序列特异性和ChIP数据等多种信息。该数据库目前涵盖17种原核生物和3种真核生物的注释数据。