sc2GWAS

sc2GWAS curates 15 078 310 candidate GWAS trait–cell regulatory pairs from > 6 300 000 individual scRNA-seq cells, applies strict QC on both scRNA-seq and GWAS datasets, and provides ranked lists of trait-relevant genes plus extensive genetic and epigenetic annotations. The platform supports trait/disease, cell-type and gene-based queries, online enrichment analyses (MAGMA, cell-type, trait-gene), interactive visualizations and bulk downloads—facilitating discovery of trait-cell-gene mechanisms.sc2GWAS 收集并整理了源自超过630万个独立单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）细胞的15078310个候选全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study, GWAS）性状-细胞调控配对；该平台对单细胞RNA测序数据集与全基因组关联分析数据集均实施严格的质量控制（Quality Control, QC），并提供性状相关基因的排序列表及丰富的遗传与表观遗传注释信息。此平台支持基于性状/疾病、细胞类型及基因的查询，涵盖在线富集分析（MAGMA、细胞类型富集、性状-基因富集）、交互式可视化与批量下载功能，助力性状-细胞-基因调控机制的发掘。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

sc2GWAS是一个综合平台，通过整合大规模单细胞数据和GWAS性状，生成了超过1500万个候选性状-细胞对，覆盖108个性状，包括复杂疾病和免疫细胞状态。该平台提供详细的注释、富集分析和可视化工具，旨在帮助用户探索GWAS性状与细胞调控机制之间的关联。