DESSO-DB

DESSO-DB provides motif prediction results and visualizations of 690 ENCODE human Chromatin Immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) data (including 161 transcription factors (TFs) in 91 cell lines) and 1,677 human ChIP-seq data (including 547 TFs in 359 cell lines) from Cistrome DB using DESSO, which is an in-house developed DL tool for motif prediction.

DESSO-DB 提供了使用自研基序预测深度学习（Deep Learning, DL）工具DESSO，对两类人类染色质免疫沉淀测序（Chromatin Immunoprecipitation sequencing, ChIP-seq）数据进行基序预测分析后得到的结果与可视化内容：其一为ENCODE项目的690组人类ChIP-seq数据，涵盖91种细胞系中的161个转录因子（Transcription Factors, TFs）；其二为Cistrome DB数据库的1677组人类ChIP-seq数据，涵盖359种细胞系中的547个转录因子（TFs）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

DESSO-DB是一个大规模人类染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）基序预测数据集，整合了来自ENCODE和Cistrome DB的共2,367个数据点，涵盖708个转录因子和450个细胞线，使用内部开发的深度学习工具DESSO进行自动化基序预测和可视化。该数据集的特点在于其广泛的覆盖范围和深度学习驱动的分析能力，为转录调控研究提供了重要资源。