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JASPAR is an open-access database of curated, non-redundant transcription factor (TF) binding profiles stored as position frequency matrices (PFMs) and TF flexible models (TFFMs) for TFs across multiple species in six taxonomic groups.

JASPAR是一个开放获取的数据库,收录经人工审核整理的非冗余转录因子(transcription factor, TF)结合谱;这些结合谱以位置频率矩阵(position frequency matrices, PFMs)和转录因子灵活模型(TF flexible models, TFFMs)的形式存储,涵盖六大分类群中多个物种的转录因子结合数据。

提供机构:
奥斯陆大学
搜集汇总
数据集介绍
JASPAR 数据集图片
背景与挑战
背景概述
JASPAR是一个开放获取的数据库,提供经过人工审核、非冗余的转录因子结合谱,这些谱以位置频率矩阵和深度学习模型的形式存储。该数据库覆盖六个分类群中的多个物种,致力于提供高质量的结合谱数据。
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