肠道微生物数据集|结直肠癌数据集

该数据集包含34名结直肠癌患者67份样本（28份粪便、39份组织）的16S rRNA（V4区）基因测序数据及T细胞浸润指标，覆盖肿瘤核心、表面及健康邻近组织，实现肠道与肿瘤微环境微生物的多场景分析。数据源自NCBI Bioproject（PRJNA909427），附带结构化元数据，整合微生物、免疫与临床信息，支持“微生物-免疫-临床”关联研究。适用于CRC微生物机制探索、宏基因组算法验证、诊断标志物筛选及生物信息学教学。

This dataset contains 16S rRNA (V4 region) gene sequencing data and T cell infiltration metrics for 67 samples (28 fecal samples and 39 tissue samples) from 34 patients with colorectal cancer (CRC). The samples cover tumor core, tumor surface and healthy adjacent tissues, enabling multi-scenario analysis of microorganisms in the gut and tumor microenvironment. Derived from NCBI Bioproject (PRJNA909427), the dataset is accompanied by structured metadata, integrates microbial, immunological and clinical information, and supports microbe-immune-clinical association studies. It is applicable to the exploration of CRC microbial mechanisms, validation of metagenomic algorithms, screening of diagnostic biomarkers, and bioinformatics teaching.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是一个结直肠癌相关的肠道微生物研究数据集，包含34名患者的67份样本（28份粪便和39份组织），通过16S rRNA（V4区）基因测序和T细胞浸润指标，覆盖肿瘤核心、表面及健康邻近组织，支持肠道与肿瘤微环境微生物的多场景分析。数据源自NCBI Bioproject（PRJNA909427），发布于2023年10月23日，总容量881.54MB，文件格式为sra和txt，由哈佛大学量化社会科学研究所IQSS发布。