Extensive sequence divergence between the reference genomes of two zebrafish strains, Tuebingen and AB(两种斑马鱼品系 Tuebingen 和 AB 的参考基因组之间存在广泛的序列差异)
收藏中国科学院水生生物研究所科学数据中心2024-08-19 更新2024-08-24 收录
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资源简介:
我们报道AB 菌株的 1.40-Gb 代表性从头基因组组装,其中重叠群 N50 长度为 21 Mb,相比公布了斑马鱼 Zv11 参考基因组(GRCz11),该基因组组装显示了 contigs 在连续性和完整性方面都有显着的改进。 此外,大量的前所未有的结构差异和广泛的序列分歧解决方案已被发现,特别是 9,029,929 个单核苷酸多态性、2,376,812 个插入缺失、32,623 个插入、22,089 个缺失和 220 个倒位,约占 DrAB1 基因组的 2.6%。 其中许多变体可能具有对表型的潜在功能影响。
提供机构:
邓羽
创建时间:
2024-08-09



