metsDB

metsDB is a comprehensive multi-omics database integrating bulk tissue, single-cell, and spatial transcriptomic data from thousands of cancer samples to elucidate the cellular and molecular mechanisms of metastasis. It catalogs alterations in cell composition, cell-cell relationships, biological pathways, molecular biomarkers, and drug responses associated with cancer spread across multiple scales. This resource enables users to search by cell or gene to access multi-view metastasis data for understanding the process and designing therapies.

metsDB是一款综合性多组学数据库（multi-omics database），整合了源自数千份癌症样本的bulk组织（bulk tissue）、单细胞（single-cell）和空间转录组（spatial transcriptomic）数据，旨在阐明癌症转移（metastasis）的细胞与分子机制。该数据库收录了与多尺度层面癌症扩散相关的细胞组成变化、细胞间相互作用关系、生物学通路、分子生物标志物以及药物响应等信息。用户可通过细胞或基因进行检索，获取多视角的癌症转移相关数据，以解析转移过程并设计治疗方案。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

metsDB是一个专注于癌症转移转录组学研究的数据库，包含1,786个Bulk RNA-seq样本、988,463个单细胞和45个空间转录组幻灯片，覆盖多种癌症类型。该数据集提供了从基因到细胞互作的多层次分析功能，旨在系统揭示癌症转移的分子机制和潜在治疗靶点。