Transcriptional profiling of striatum and cortex from a mouse model of Huntington's disease (Q140) crossed with Pms1 heterozygous and homozygous mice

Cerebral cortex and striatum were isolated from 6-month old Pms1+/- and Pms1-/- mice crossed with the Q140 knock-in (KI) mice and their respective controls. Transcriptomic analysis (RNASeq) was performed on 6 genotypes: WT, Q140, Psm1+/-, Q140 X Psm1+/-, Psm1-/-, and Q140 X Psm1-/-, 8 replicates per genotype. RNASeq analysis was performed on samples from the cerebral cortex and striatum tissues of 6 months old wild type, Q140, Psm1+/-, Q140 X Psm1+/-, Psm1-/-, and Q140 X Psm1-/- mice. N = 16 per group (8M/8F)本研究从与Q140敲入（KI）小鼠及其对应对照交配获得的6月龄Pms1+/-与Pms1-/-小鼠体内，分离大脑皮层与纹状体组织。针对6种基因型的样本开展转录组学分析（RNASeq）：野生型（WT）、Q140、Psm1+/-、Q140×Psm1+/-、Psm1-/-以及Q140×Psm1-/-，每种基因型设置8个生物学重复。本次RNA测序分析的样本覆盖上述6种基因型6月龄小鼠的大脑皮层与纹状体组织，每组样本量为16（8只雄性，8只雌性）。