SolPGD

SolPGD is an open-access portal that aggregates inter- and intra-species pan-genomes for the Solanaceae family, providing gene presence/absence matrices, syntenic orthology, functional annotations and interactive genome browsers across tomato, potato, pepper, tobacco and other solanaceous crops to accelerate comparative genomics and crop improvement.SolPGD是一个开放获取门户，聚焦茄科（Solanaceae）类群，整合了该科物种的种间与种内泛基因组资源，可为番茄、马铃薯、辣椒、烟草及其他茄科作物提供基因存在/缺失矩阵、共线性直系同源数据、功能注释信息以及交互式基因组浏览器，以助力比较基因组学研究与作物遗传改良。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

SolPGD是一个开放的茄科植物泛基因组数据库，整合了种间和种内的泛基因组数据，提供基因存在/缺失矩阵、同线同源关系、功能注释和交互式基因组浏览器等资源。该平台旨在促进番茄、马铃薯、辣椒和烟草等重要作物的比较基因组学研究，加速作物改良进程。