CjPCA

To understand the cellular composition and region-specific specialization of white matter - a disease-relevant, glia-rich tissue highly expanded in primates relative to rodents - we profiled transcriptomes of ~500,000 nuclei from 19 tissue types of the central nervous system of healthy common marmoset and mapped 87 subclusters spatially onto a 3D MRI atlas. We performed cross-species comparison, explored regulatory pathways, modeled regional intercellular communication, and surveyed cellular determinants of neurological disorders. Here, we analyze this resource and find strong spatial segregation of microglia, oligodendrocyte progenitor cells, and astrocytes.为解析白质的细胞构成与区域特异性特化——白质是一种与疾病密切相关、富含神经胶质细胞的组织，且相较于啮齿类，在灵长类动物中显著扩增——我们对健康普通狨猴（common marmoset）中枢神经系统19种组织类型的约50万个细胞核进行了转录组分析，并将87个细胞亚簇通过空间定位映射至三维磁共振成像（MRI）图谱中。我们开展了跨物种比较分析，探究了调控通路，构建了区域细胞间通讯模型，并梳理了神经系统疾病的细胞决定因素。本研究对该数据集资源进行分析后，发现小胶质细胞（microglia）、少突胶质细胞前体细胞（oligodendrocyte progenitor cells）与星形胶质细胞（astrocytes）存在显著的空间分隔现象。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CjPCA是一个狨猴脑细胞转录组图谱数据集，通过对约50万个细胞核进行转录组分析，揭示了中枢神经系统不同区域的细胞组成和空间分布。该研究进行了跨物种比较和细胞间通信建模，并探讨了神经系统疾病的细胞基础。