TRRUST

TRRUST (v2) 是一个通过基于语句的文本挖掘方法构建的人工整理数据库，专注于人类和小鼠的转录调控网络。它包含800个人类转录因子（TFs）的8,444条调控关系和828个小鼠TFs的6,552条调控关系，这些数据从11,237篇PubMed文献中提取，描述了小规模实验研究中的转录调控。数据库还提供了调控模式信息（激活或抑制）。

TRRUST (v2) is a manually curated database constructed via sentence-based text mining approaches, focusing on transcriptional regulatory networks of humans and mice. It contains 8,444 regulatory relationships for 800 human transcription factors (TFs) and 6,552 regulatory relationships for 828 mouse TFs, which are extracted from 11,237 PubMed articles describing transcriptional regulations in small-scale experimental studies. The database also provides regulatory mode information, namely activation or repression.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

TRRUST是一个专注于人类和小鼠转录因子与靶基因调控关系的数据集，通过人工策展和文献挖掘构建，包含调控方向和支持文献的详细信息。其特点是基于实验证据（如ChIP-Seq、shRNA）的高质量数据，适用于转录调控网络研究。