PBMC scRNAseq Kang 2018, RDS dgCMatrix and H5 sparse data

RDS files contain "dgCMatrix" class objects for sparse raw counts of the downsampled datasets: GSE96583 (Kang et al, Nature Biotechnology, 2018)H5 files follows the 10X CellRanger output format.These datasets are prepared primarily for the use of presenting LIGER integration method.File "pbmc_ifnb_example.tar.gz" contains folder structure of following CellRanger output format.

RDS文件存储了下采样数据集GSE96583（Kang等，《自然·生物技术》，2018年）的dgCMatrix类稀疏原始计数对象。H5文件遵循10X CellRanger输出格式。本系列数据集主要用于演示LIGER整合方法。文件"pbmc_ifnb_example.tar.gz"包含符合CellRanger输出格式的文件夹结构。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集提供了Kang等人2018年研究中PBMC的单细胞RNA测序数据，以RDS和H5格式存储，适用于生物信息学分析，特别是LIGER整合方法的演示。