bio-ESMD进行扩展性测试数据集

在海洋之光超级计算机上，使用定制的分子动力学软件bio-ESMD，对UBQ蛋白水溶液体系进行了扩展性测试，时间步长为1 fs，产生了系统的统计量日志，有助于验证bio-ESMD在神威平台上的扩展性。该数据集是面向国产超算访存墙所设计的具有一定通用性的生物体系分子动力学在软件在模拟真实复杂体系的产物，对于分析该软件模拟时的潜在问题与价值有重要参考意义。数据集大小：1.9 GB。

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背景与挑战

背景概述

该数据集为在海洋之光超级计算机上使用bio-ESMD分子动力学软件对UBQ蛋白水溶液体系进行扩展性测试的产物，时间步长1 fs，产生的统计量日志可用于验证软件在神威平台上的扩展性。数据集包含1264个文件，总大小1.9 GB，面向国产超算访存墙设计，具有一定的通用性，对分析模拟潜在问题与价值有重要参考意义。