Klebsiella pneumoniae strain:TR231-m Genome sequencing and assembly. Klebsiella pneumoniae strain:TR231-m

NIAID Data Ecosystem2026-03-10 收录

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA328301

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cgMLST

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2017-11-06

BIGSdb

BIGSdb（Bacterial Isolate Genome Sequence Database）是一个用于存储和分析细菌基因组序列的数据库。它主要用于基因分型和序列分析，支持多种细菌基因组数据的存储和查询。

bigsdb.pasteur.fr4430

BacBench

BacBench是一个多尺度、多任务的基准，用于评估跨越细菌生命树的细菌基因组学的机器学习模型。目前BacBench包括6个从公共数据库收集和整理的任务：(1) 必需基因预测，(2) 操纵子识别，(3) 蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)，(4) 菌株聚类，(5) 抗生素抗性预测和(6) 表型性状预测。

github2025-05-28 更新900

SSCmec typing

SSCmec typing was done using staphopia-sccmec v1.0.0 from staph-typer sub-workflow included in Bactopia tools and SCCmecFinder 1.2

DataCite Commons2025-06-01 更新390

AllTheBacteria

包含截至2023年6月的所有细菌WGS分离株INSDC数据，统一组装、质量控制、注释，可搜索。

github2024-05-22 更新1270

Expression of the locus of enterocyte effacement genes during the invasion process of the atypical enteropathogenic Escherichia coli 1711-4 strain of serotype O51:H40. Supplementary Material

The present data set bring information about E. coli genomes used in the study and the virulence factors identified in aEPEC 1711-4 compared with typical EPEC E2348/69, EHEC O157:H7 str. Sakai

DataCite Commons2024-08-17 更新560