pytc/zebrafinch-j0126

该数据集来源于一篇生物学论文，数据被下载并处理成更容易分享的格式。数据集包括训练、验证和测试数据，分别以压缩包和.h5文件形式提供。训练数据包含34个密集标记的子体积，验证数据包含12个神经元的手动追踪骨架，测试数据包含50个神经元的手动追踪骨架。此外，还提供了使用cloud-volume工具从neuroglancer链接下载的图像和FFN结果。

This dataset originates from a biological research article. The raw data was downloaded and processed into a more readily shareable format. The dataset encompasses training, validation, and test subsets, which are provided in both compressed archives and .h5 file formats. The training set comprises 34 densely annotated subvolumes; the validation and test sets contain manually traced skeletons of 12 and 50 neurons respectively. Additionally, images and FFN results downloaded from Neuroglancer links via the cloud-volume tool are also provided.

原始信息汇总

数据集概述

数据来源

• 数据集来源于论文《[FFN paper]》及其相关数据链接。

数据内容

• Ground truth

  • 训练集: j0126-train-34vol.zip, 包含34个密集标注的子体积。
  • 验证集: valid_12_skeletons.h5, 包含12个手动追踪的神经元骨架。
  • 测试集: test_50_skeletons.h5, 包含50个手动追踪的神经元骨架。

• 图像和FFN结果

  • 使用cloud-volume工具从neuroglancer链接下载。
  • 图像数据: precomputed://gs://j0126-nature-methods-data/GgwKmcKgrcoNxJccKuGIzRnQqfit9hnfK1ctZzNbnuU/rawdata_realigned
  • FFN分割结果: precomputed://gs://j0126-nature-methods-data/GgwKmcKgrcoNxJccKuGIzRnQqfit9hnfK1ctZzNbnuU/ffn_segmentation