IxoriDB

We used single salivary glands and midguts dissected from individual siblings adult pathogen-free female Ixodes ricinus to reduce genetic variability between individual ticks. The comprehensive analysis of 88 obtained RNA-seq data sets allows us to provide high-quality annotated sialomes and mialomes from individual ticks. Comparisons between fed/unfed, timepoints, and exposures yielded as many as 3000 putative differentially expressed genes (DEG).我们从同系、无病原体的成年雌性蓖麻硬蜱（Ixodes ricinus）的单只个体中解剖获取单个唾液腺与中肠，以降低不同蜱虫间的遗传变异度。对获取的88套RNA测序（RNA-seq）数据集开展全面分析后，我们得以获得单只蜱虫的高质量注释版唾液腺组（sialome）与中肠组（mialome）。对进食/未进食状态、不同时间点以及不同暴露条件下的样本进行比较，共鉴定出多达3000个推定差异表达基因（DEG）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

IxoriDB是一个基于88个Ixodes ricinus样本转录组构建的数据库，旨在为科学社区提供快速获取序列信息、表达数据和功能注释的工具。它支持通过转录本ID、蛋白质ID、特征或序列比对等方式浏览和查询数据，涵盖不同组织、摄食阶段和蛋白质特征的分析。